Cada clã da um Bônus para o membro do mesmo seja vantajoso ou desvantajoso. Abaixo o bônus de cada clã:
Clã Aburame: Manipulação de insetos + 50 Ninjutsu + Hijutsus até rank B inicialmente
Clã Akimichi: Manipulação de Gordura + 60 Força + 50 taijutsu - 10 velocidade + Hijutsus até rank B inicialmente + 300 Stamina
Clã Hatake: invocação de cães + 50 agilidade + Hijutsus até rank B inicialmente + 50 Stamina
Clã Hyuuga: Byakugan + 50 Taijutsu +100 velocidade + Hijutsu até rank B inicialmente + 50 Stamina
Clã Inuzuka: Permite ter um cão de estimação + 50 de velocidade + Hijutsus até rank B + 50 Stamina
Clã Kaguya: Manipulação dos Ossos + 50 Taijutsu + 50 Força - 50 HP + Hijutsu até rank B
Clã Kurama: +300 Genjutsu + 100 chakra + Hijutsus até rank B
Clã Nara: +50 Ninjutsu + Hijutsu até rank B
Clã
Senju: + 100 chakra + 100 HP + 100 Stamina + Manipulação do Doton +
Manipulação do Suiton + Manipulação do Mokuton + Hijutsus até rank B
Clã Uchiha: +100 chakra + 100 Ninjutsu + 100 Genjutsu + 600 agilidade + Hijutsus até rank B
Clã Uzumaki: 5x chakra inicial + 100 Ninjutsu + Hijutsus até rank B
Clã Yamanaka: +100 Genjutsu + 100 chakra + Hijutsu até rank B
Clã Yuki: Manipulação do Hyouton (Gelo) + 100 chakra + 100 velocidade + Hijutsu até rank B
Os demas clãs apenas Hijutsu até Rank B. Para os atuais jogadores atualizem suas fichas.
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